一、越夏菌棒处理

　　水浸泡、被埋的越夏菌棒先用清水或自来水冲洗干净，再用杀菌剂或石灰水喷洒表面后，移至阴凉、干燥、通风、避光的场所散开放置。吸水过多的菌棒，用以上方法处理后，将菌棒塑料袋顶端和底部用刀割小口，排放架上或斜立于畦床上，加强通气排湿、排水。在整理或转移菌棒时要注意不要过度振动菌棒防止提前出菇。

　　二、出菇(耳)菌棒处理

　　未被洪水浸泡或短时间浸泡的出菇菌棒，要及时抢收菇耳，进行保鲜处理或晾晒、烘干。对于长时间洪水浸泡的出菇菌棒，要将坏死的菇蕾和成熟耳片及时采摘清理，进行杀菌消毒和防虫处理，避免坏死菇(耳)腐烂引发病虫害。

　　三、培养料处理

　　如果培养料被洪水浸泡，等天气晴朗后，及时摊晾、暴晒后保存备用，建议与未被浸泡的培养料搭配使用，提高食用菌的产量。

　　四、损坏菇棚修整

　　倒塌或严重毁坏的菇棚要拆除后重新搭建。损坏较轻的菇棚及时进行加固，大棚顶部及四周重新覆盖遮荫物料，避免棚内菌棒日晒雨淋，并注意保持通风，防止发生高温高湿烂棒情况。

　　五、发菌场所、菇棚的清理

　　对于淤积泥水的发菌场所、菇棚，应先排除积水，然后将淤泥和杂物清理干净，用二氧化氯喷洒或擦洗地面和墙壁，通风除湿干燥后再用。

　　六、灾后病虫害防治

　　水灾过后，蚊虫易滋生，菇棚或发菌场周边环境要进行统一杀虫、消毒一次。对于菇蚊等虫害可喷施低毒低残留的杀虫药剂;对于局部感染杂菌的菌棒可采用二氯异氰尿酸钠等药剂或生石灰进行喷雾或涂抹处理;对于已感染绿霉并且发软的菌棒及时挑出处理，防止杂菌蔓延扩散。